O Manchester City foi fundado em 1880 por Anna Connell e dois secretïrios da igreja de Sïo Marcos em Manchester. Inicialmente o clube ficou conhecido como "St. Marks (West Gorton)". Porïm, depois da mudanïa para o leste da cidade, o nome mudou para Ardwick A.F.C. O Ardwick foi um dos fundadores da segunda divisïo inglesa em 1892, mas, apïs problemas financeiros em 1894, o clube foi reestruturado, e o nome mudou novamente, dessa vez para Manchester City F.C.

O Manchester City conquistou o seu primeiro grande tïtulo em 1904, quando bateu o Bolton Wanderers na final da FA Cup, a Copa da Inglaterra. Em 1906, um escïndalo atingiu o clube e 17 jogadores foram suspensos por alegaïïes de corrupïïo. Em 1923, o Manchester City se mudou para Maine Road, no bairro operïrio de Moss Side. Outro tïtulo da FA Cup veio em 1934, seguido pela conquista do Campeonato Inglïs da primeira divisïo em 1937.

O tri da Copa da Inglaterra chegou em 1956, em uma das finais mais famosas da histïria. Na ocasiïo, o goleiro do City, Bert Trautmann, ex-prisioneiro de guerra alemïo, continuou jogando mesmo depois de sofrer uma lesïo na nuca em uma colisïo com um adversïrio.

O Manchester City foi rebaixado em 1963, mas se recuperou com os tïcnicos Joe Mercer e Malcolm Allison, que dirigiram o clube durante o perïodo de maior ïxito da sua histïria. O City conquistou o Campeonato Inglïs pela segunda vez em 1968, levou a FA Cup para casa mais uma vez em 1969 e completou a boa fase conquistando o primeiro tïtulo europeu em 1970, com uma vitïria sobre o Gornik Zabrze da Polïnia na final da antiga Recopa Europïia, disputada pelos campeïes das copas nacionais.

Depois dos anos gloriosos no final da dïcada de 1960 e inïcio da dïcada de 1970, a sorte comeïou a desaparecer. O tïtulo em 1976 da League Cup (copa inglesa de menor importïncia) e a chegada ï final da Copa da Inglaterra em 1981 foram as ïnicas alegrias dos torcedores em Maine Road durante muito tempo. Em 1998, o clube chegou ao momento mais difïcil da sua histïria, ao cair para a terceira divisïo. Pela primeira vez uma equipe que havia conquistado um trofïu em nïvel continental caïa a uma divisïo tïo baixa no seu païs.

O carismïtico tïcnico Kevin Keegan liderou o Manchester City de volta ï Premier League em 2002, e o clube vem se mantendo desde entïo entre os grandes da Inglaterra, mas sem chegar perto das primeiras posiïïes.

Em 2007, o ex-primeiro ministro da Tailïndia Thaksin Shinawatra assumiu o City e trouxe o ex-tïcnico da seleïïo inglesa Sven-Gïran Eriksson. Ao fim da temporada, a dïcima colocaïïo foi considerada uma decepïïo, e o sueco acabou substituïdo por Mark Hughes, ex-jogador do Manchester United e da seleïïo do Païs de Gales.

No dia 1ï de setembro de 2008, um grupo de investimentos de Abu Dhabi assumiu o controle e jï mostrou a intenïïo de levar o City ï elite internacional, adquirindo o brasileiro Robinho do Real Madrid por uma quantia avaliada em 32,5 milhïes de libras (R$ 100 milhïes), um recorde para o futebol britïnico.

O Manchester City manda as suas partidas no magnïfico City of Manchester Stadium desde 2003, quando deixou o velho estïdio Maine Road. Os torcedores sïo famosos pela lealdade. Entre os grandes jogadores a terem vestido a camiseta do Manchester City estïo Billy Meredith, Bert Trautmann, Mike Summerbee, Colin Bell, Francis Lee e Georgi Kinkladze.